fix(config): overlay cron command flag from system configs (#1285)

Author: zezaeoh

internal/config/config_extras_test.go

@@ -283,6 +283,7 @@ func TestApplySystemConfigs(t *testing.T) {
 		"tools.browser.enabled":     "false",
 		"tools.browser.remote_url":  "ws://chrome:9222",
 		"tools.browser.max_pages":   "9",
+		"cron.command_enabled":      "true",
 	})
 
 	if cfg.Agents.Defaults.Provider != "openai" {
@@ -306,6 +307,9 @@ func TestApplySystemConfigs(t *testing.T) {
 	if cfg.Tools.Browser.MaxPages != 9 {
 		t.Errorf("tools.browser.max_pages: got %d", cfg.Tools.Browser.MaxPages)
 	}
+	if !cfg.Cron.CommandEnabled {
+		t.Error("cron.command_enabled: got false, want true")
+	}
 }
 
 // --- Save / Load round-trip ---

internal/config/config_system.go

@@ -95,6 +95,7 @@ func (c *Config) ApplySystemConfigs(configs map[string]string) {
 	// Cron
 	integer("cron.max_retries", &c.Cron.MaxRetries)
 	str("cron.default_timezone", &c.Cron.DefaultTimezone)
+	boolValue("cron.command_enabled", &c.Cron.CommandEnabled)
 
 	// Pending message compaction
 	if _, ok := configs["compaction.threshold"]; ok {